2009 kam JAL in große finanzielle Schwierigkeiten. Nach angehäuften Schulden in Höhe von über 15 Milliarden Euro (!) drohte die viertgrößte Firmenpleite in der japanischen Geschichte. Der rigorosen Umstrukturierung und dem staatlichen Sanierungsplan fielen u.a. die Boeing 747 zum Opfer, ein Drittel der Belegschaft (über 15.000 Mitarbeiter) wurde entlassen. Nur zwei Jahre später folgte die erfolgreiche Rückkehr an die tokyoter Börse.