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Prag ist mit beiden Lufthansa-Drehkreuzen durch Direktflüge der Lufthansa verbunden. Da Smartwings als größter Anbieter vor Ort ohne Zugehörigkeit zu einer Luftfahrtallianz ist, verfügt Prag auch nicht über den Zubringerverkehr von entsprechenden Partnerairlines. Die Star Alliance ist mit Lufthansa, TAP, Turkish Airlines, LOT, SAS, Swiss, Egypt Air, Croatia Airlines, Aegean Airlines und Austrian Airlines aber gut vernetzt.